الجغرافيا الاقتصادية نظام واسع جدًا يستخدم فيه الجغرافيون الاقتصاديون منهجيات مختلفة في دراستهم للظواهر الاقتصادية في العالم. تطورت بعض هذه المناهج الدراسية مع مرور الزمن:

تركز جغرافيا الاقتصاد النظرية على بناء نظريات عن التنظيم المكاني وتوزيع النشاطات الاقتصادية.
تدرس جغرافيا الاقتصاد الإقليمية الظروف الاقتصادية في مناطق معينة أو بلدان معينة من العالم. تتعامل مع الهيكلة الإقليمية الاقتصادية بالإضافة إلى التطوير الاقتصادي المحلي.
تدرس جغرافيا الاقتصاد التاريخية تاريخ وتطور البنية الاقتصادية المكانية. وباستخدام البيانات التاريخية تتمكن هذه الجغرافيا من دراسة آلية انتقال مراكز النشاط الاقتصادي والتجمع السكاني، وأية أنماط من التخصص الإقليمي قد تطورت مع الوقت والعوامل التي تفسر هذه التغيرات.
تتبنى جغرافيا الاقتصاد التطورية منهجًا تطوريًا للجغرافيا الاقتصادية، وعلى وجه التحديد تستخدم جغرافيا الاقتصاد التطورية مفاهيم وأفكار من علم الاقتصاد التطوري لفهم تطور المدن والمناطق والأنظمة الاقتصادية الأخرى.
الجغرافيا الاقتصادية النقدية وهي منهج مأخوذ من وجهة نظر الجغرافيا النقدية المعاصرة وفلسفتها.
تدرس الجغرافيا الاقتصادية السلوكية العمليات الإدراكية التي يستند إليها التفكير المكاني واتخاذ القرارات بشأن الموقع وسلوك الشركات والأفراد.
تجري مقاربة الجغرافيا الاقتصادية بكونها فرع من الجغرافيا البشرية يركز على الأنظمة الإقليمية للنشاط الاقتصادي البشري. يمكن تنظيم وصف بديل عن مناهج دراسة النشاط الاقتصادي البشري عن التحليل المكاني الزماني وتحليل إنتاج/استهلاك العناصر الاقتصادية وتحليل التدفق الاقتصادي. تشمل أنظمة التحليل المكاني الزماني النشاطات الاقتصادية للمنطقة والمساحات الاجتماعية المختلطة والتطوير.

في المقابل قد يركز التحليل على الإنتاج والتبادل والتوزيع ونشاط استهلاك العناصر الاقتصادية. يستطيع الجغرافي أن يدرس أيضًا التدفق المادي وتدفق المواد الخام وتدفق السكان وتدفق المعلومات من أجزاء مختلفة من نظام النشاط الاقتصادي، وذلك من خلال السماح بتنوع مقاييس الزمان والمكان والعنصر. ومن خلال تحليل التدفق والإنتاج تُربط المناطق الصناعية ومناطق السكن المدنية والريفية وموقع النقل ومرافق الخدمات التجارية والتمويل والمراكز الاقتصادية الأخرى ضمن نظام نشاط اقتصادي.

الأفرع
تُقسم الجغرافيا الاقتصادية من ناحية الموضوع إلى هذه الأنظمة الفرعية:

جغرافيا الزراعة
تُعد تقليديًا فرعًا من الجغرافيا الاقتصادية التي تدرس أجزاء سطح الأرض التي حولها البشر من خلال نشاطات القطاع الأولي. تركز بالتالي على بنية المناظر الطبيعية الزراعية وتطالب بالعمليات التي تؤدي لهذه النماذج المكانية. يركز معظم البحث في هذا المجال على الإنتاج أكثر من الاستهلاك إلا أنه بالإمكان التمييز بين البحث بالاعتماد على القانون (مثلًا: توزيع العمليات والنماذج الزراعية المكانية) والبحث الفردي (مثلًا: التفاعل بين الإنسان والبيئة وتشكيل المناظر الطبيعية الزراعية). وفي الغالب يطبق المنهج الثاني من الجغرافية الزراعية ضمن الجغرافية الإقليمية.

جغرافية الصناعة
جغرافيا التجارة الدولية
جغرافيا الموارد
جغرافيا النقل والاتصالات
جغرافيا التمويل
قد تتداخل هذه المجالات الدراسية مع علوم جغرافية أخرى.